12 февраля 2011 год.
Нью-Йорк.
Люди узнали о мутантах.Конечно же они в шоке от того что узнали.теперь люди боятся ходить ночью,да и днем тоже.Они думаю что мутанты нападут на них и убьют их.Вскоре президент выступает с лекцией о том что мутанты опасны.Не которые мутанты присутствуют на выступление.Засветились такие известные мутанты как Пиро,Леди Смертельный Удар,Саблезубый,Жаба и Пузырь.
Магнето и Мистик находят способ вернуть свои способности.
Они решают отомстить человечеству за то ,что они лишили их сил.Вновь два самых опасных мутанта собирают армию мутантов,которые могут уничтожить человечество.но на этот раз,Магнето выбирает идеальных мутантов и собирает новую команду под название "Братство Мутантов."
Феникс и Циклоп воскресают из мёртвых.В Джине так же остается частичка Темного Феникса.Силы Джины были увеличены,но она временно контролировала силу.Скотт становится физически сильнее и его разрушительные лучи становятся на много сильнее по силе.
Между Джиной и Скотт вновь появляется понимание и любовь.Первое время,Скотт стеснялся быть с Джиной,но вскоре решился быть со своей любовь и теперь они снова вместе.
Росомаха начинает вспоминать своё прошлое.Он вспоминает как он попал в Оружие Икс,как он скрывался от агентов Оружия в деревне,как Оружие Икс убило невинных людей.В конец он вспомнил что он спас Мистик от превращение в Оружие Икс.Вскоре же объявляется Серебряная Лиса.Она влияет на Логана и вскоре они понимают что всё ещё любят друг друга.
Шторм управляет "Школой для Одарённых Детей".Профессор бесследно исчез.Поэтому Орора и Логан управляет школой.
В школу постоянно прибывают новые мутанты.Каждый день новый мутант появляется в дверях школы.
Магнето начинает войну!
А на чьей ты стороне?